La Asamblea General es el máximo órgano de gobierno de FAEX y está integrado por representantes de las asociaciones que componen Federación, de la cual dependen la Junta de Gobierno y la Secretaría Técnica.
La Junta de Gobierno tiene funciones ejecutivas y desarrolla un papel activo de dirección y gobierno de la entidad así como de representación del colectivo Alzheimer.
La Secretaría Técnica es el órgano de información, apoyo técnico y ejecución de las decisiones de la Junta de Gobierno y de la Asamblea General.
